Üniversitelerde karar alma yetkisinin demokratik yöntemlerle seçilmiş̧ kurullarda ve akademik yöneticilerde olması özerklik için şarttır. Rektör, dekan, enstitü müdürü, yüksekokul müdürü, bölüm başkanı gibi akademik yöneticiler atamayla değil seçimle belirlenmelidir.
2002’de AK Parti Sarıyer İlçe Teşkilatı kurucusu, 2015’te de AK Parti İstanbul 1. bölge milletvekili aday adayı olan Prof. Melih Bulu, Boğaziçi Üniversitesi’ne rektör olarak atandı, öğrenciler tepki gösterdi.
Birikmiş maaşlarını ve tazminatlarını alamadan işten çıkarılan Bimeks işçileri, patronları Vedat Akgiray’ın ders verdiği Boğaziçi Üniversitesi’nin önünde eylem yaptı. İşçilerden 7’si gözaltına alındı.
Boğaziçi Üniversitesi’nde 3’ü akademisyen 4 çalışan FETÖ operasyonu kapsamında gözaltına alındı. Konuya ilişkin öğretim üyelerinin Çarşamba günü üniversitede bir açıklama yapacağı öğrenildi.
Boğaziçi Üniversitesi’nde akademisyenler üniversite rektörlüğüne aday bile olmamasına rağmen Erdoğan tarafından Mehmed Özkan’ın atanmasına tepki göstererek kampüs içinde açıklama gerçekleştirdi
Barış İçin Akademisyenler soruşturmalara ilişkin hak ihlallerini bir raporla derlediler ve 16 Mart 2016 günü kamuoyu ile paylaştılar. Rapor metnini okuyan dört akademisyenden üçü gözaltına alınıp tutuklandı. Esra Mungan o raporu okuyup tutuklanan ve Bakırköy Kadın Kapalı Ceza İnfaz Kurumuna gönderilen akademisyenlerden biri.
